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酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)常見問題
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- 【資料簡(jiǎn)介】
1.如果誘餌蛋白對(duì)酵母細(xì)胞是有毒的,該怎么辦?
在某些情況下,在液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)不好的菌珠可以在固體培養(yǎng)基上生長得很好。首先重懸克隆于1ml的SD/–Trp,接著將重懸液平鋪于5 個(gè)100-mm的SD/–Trp平板,在30℃下溫浴,直至平板上的克隆相互粘在一起。用5ml 0.5X YPDA刮下每塊板上的克隆,并收集到一管中,這樣就可以使用這個(gè)細(xì)胞重懸液進(jìn)行正常的雜交反應(yīng)。
2.如果誘餌蛋白能直接激活報(bào)告基因的表達(dá),該如何處理?
該蛋白很可能有轉(zhuǎn)錄激活域,是個(gè)轉(zhuǎn)錄因子?梢酝ㄟ^基因重組切掉轉(zhuǎn)錄激活域,然后重新檢測(cè)其是否自激活,但要注意重組也有可能破壞蛋白之間的互作。
3.轉(zhuǎn)化效率太低怎么辦?
可以采用以下方法解決:
1)檢測(cè)一下DNA的純度,如果可以的話,重新用乙醇純化。
2)DNA-BD/誘餌蛋白很可能是有毒的。
3)不適當(dāng)?shù)呐囵B(yǎng)基,重新配制培養(yǎng)基,并做對(duì)照轉(zhuǎn)化。
4)檢測(cè)pGBT9對(duì)照載體的轉(zhuǎn)化效率,放置于SD/–Trp平板上,轉(zhuǎn)化效率應(yīng)該在1 x105 colonies/mg DNA以上。
4.雜交效率不高,該如何處理?
在雜交中,預(yù)轉(zhuǎn)化的誘餌細(xì)胞的數(shù)量可能不夠。當(dāng)對(duì)誘餌菌株進(jìn)行液體培養(yǎng)過夜時(shí),應(yīng)挑選大的、新鮮的克隆進(jìn)行培養(yǎng),經(jīng)過離心和重懸后,再使用血球計(jì)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。密度應(yīng)該在1 x109/ml。
一個(gè)甚至兩個(gè)融合蛋白對(duì)酵母細(xì)胞有毒。你可以通過重組方法來減輕毒性,同時(shí)又能保證蛋白的相互作用;蛘呤褂帽磉_(dá)水平較低的載體。也可以在瓊脂平板或?yàn)V膜上進(jìn)行雜交。但同時(shí)必須作雜交對(duì)照實(shí)驗(yàn)。
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