MSN交談
您所在位置：請輸入產(chǎn)品關(guān)鍵字：
BMC Genomics：鑒定蟹卵巢小RNA組
點(diǎn)擊次數(shù)：845 發(fā)布時間：2014-7-26
microRNA（miRNA）是非編碼小RNA分子，與靶信使RNA（mRNA）的3'-非翻譯區(qū)（UTR）堿基配對，下調(diào)基因表達(dá)。然而，關(guān)于十足目甲殼動物miRNA的詳細(xì)信息并不多見。上海海洋大學(xué)邱高峰教授帶領(lǐng)的團(tuán)隊早期研究發(fā)現(xiàn)，中華絨螯蟹（Eriocheir sinensis）的細(xì)胞周期蛋白B（cyclin B）的3'-UTR上存在許多miRNA結(jié)合位點(diǎn)，暗示miRNA可能在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控細(xì)胞周期蛋白B。在本研究中，邱教授團(tuán)隊采用測序技術(shù)對中華絨螯蟹的卵巢小RNA組進(jìn)行了全面鑒定，深入探討了miRNA在卵母細(xì)胞減數(shù)分裂過程中的作用*，研究成果發(fā)表在7月刊的BMC Genomics上。
研究人員采用高通量測序?qū)χ腥A絨螯蟹的卵巢小RNA組進(jìn)行分析（小RNA測序項目由聯(lián)川生物承擔(dān)完成），鑒定出來自44個miRNA家族的55個已知miRNAs，并預(yù)測出136個可能存在未知的miRNAs。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，四個miRNAs（miR-2，miR-7，miR-79和miR-133）的5'種子序列，互補(bǔ)于細(xì)胞周期蛋白B的3'-UTR的miRNA結(jié)合位點(diǎn)。實(shí)時定量PCR分析發(fā)現(xiàn)，miR-2和miR-133表達(dá)豐度在減數(shù)*次分裂中期（MI）的表達(dá)豐度遠(yuǎn)高于胚泡期（GV）。但它們的表達(dá)增強(qiáng)不依賴于*釋放激素（GnRH）的誘導(dǎo)。研究人員采用雙熒光素酶報告基因測定法進(jìn)行進(jìn)一步表達(dá)分析，結(jié)果顯示miR-2和miR-133可下調(diào)螃蟹細(xì)胞周期蛋白B基因的3'-UTRs的表達(dá)，這表明它們能抑制細(xì)胞周期蛋白B的翻譯。免疫印跡試驗(yàn)分析證實(shí)，在受精卵中，細(xì)胞周期蛋白B蛋白會在減數(shù)*次分裂的中期—后期過渡中*消失，這表明了在接近MI結(jié)束時miR-2和miR-133可能具有破壞細(xì)胞周期蛋白B的功能。
此研究中從蟹卵巢小RNA組中鑒定出了大量的miRNAs，同時發(fā)現(xiàn)miR-2和miR-133在卵母細(xì)胞減數(shù)分裂成熟過程中表現(xiàn)出差異表達(dá)，并可以調(diào)控蟹細(xì)胞周期蛋白B基因的3'-UTR。值得注意的是，該研究發(fā)現(xiàn)與zui近報道的miRNA活性在小鼠卵母細(xì)胞中被整體抑制是不一致的。
* Song YN, Shi LL, Liu ZQ, Qiu GF. Global analysis of the ovarian microRNA transcriptome: implication for miR-2 and miR-133 regulation of oocyte meiosis in the Chinese mitten crab, Eriocheir sinensis (Crustacea:Decapoda) (2014) BMC Genomics doi: 10.1186/1471-2164-15-547
聯(lián)川生物為研究人員提供從miRNA發(fā)現(xiàn)到靶基因鑒定的全程解決方案
聯(lián)川生物總部位于美國休斯敦（LC Sciences, LLC），經(jīng)過多年的快速發(fā)展，已成為業(yè)界的多組學(xué)技術(shù)服務(wù)商。公司擁有具有自主知識產(chǎn)權(quán)的µParaflo®微流體定制化芯片平臺，可以為科研用戶提供從基因組，轉(zhuǎn)錄組，到蛋白組的高通量定制化表達(dá)譜芯片解決方案。我們是提供microRNA表達(dá)譜芯片分析的服務(wù)商。作為早提供高通量測序技術(shù)服務(wù)的公司之一，聯(lián)川生物擁有經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)團(tuán)隊和*的生物信息學(xué)專家組，可以為研究人員提供多組學(xué)測序服務(wù)和深度個性化數(shù)據(jù)分析解決方案。為滿足研究人員跨組學(xué)高通量研究需求，聯(lián)川生物已將蛋白質(zhì)組定量分析引入技術(shù)服務(wù)線，為用戶提供貫穿中心法則的全程解決方案。多年來，聯(lián)川生物一直與國內(nèi)的科研團(tuán)隊保持著長期緊密的合作，助力科研人員在生物、醫(yī)學(xué)、和農(nóng)林領(lǐng)域的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。科研用戶使用聯(lián)川生物的科研服務(wù)和高質(zhì)量組學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)已發(fā)表了逾600篇高水平研究論文，其中已在Cell，Nature，Science系列*期刊上發(fā)表論文十七篇。