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熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)

時(shí)間:2015-3-2閱讀:4305
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1.熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建
靶基因3UTR的獲得。3UTR序列是指從Mrnaz終止密碼子后的*個(gè)堿基開始到mRNAzui后一個(gè)堿基(通常是polyA結(jié)尾)。模板可采用相應(yīng)物種的cDNA或基因組。在選擇模板時(shí)要注意:一般來講,cDNA適于所有的3UTR擴(kuò)增,但有時(shí)3’端AT過多導(dǎo)致引物設(shè)計(jì)困難時(shí),可以考慮用基因組做模板。但是基因組做模板的前提是靶基因3UTR由一個(gè)外顯子組成。一般盡可能全面的擴(kuò)增3UTR,但如果3UTR過長(zhǎng)或引物設(shè)計(jì)困難,可以選取包括miRNA結(jié)合位點(diǎn)的一段3UTR

2.熒光素報(bào)告基因質(zhì)粒轉(zhuǎn)染
開始做報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)前,你還需要準(zhǔn)備以下材料:
1TK質(zhì)粒,作為共轉(zhuǎn)染的內(nèi)參。
2miRNA的過表達(dá)質(zhì)粒或合成的miRNA。質(zhì)粒的濃度盡量在500ng/ul以上,合成的miRNA稀釋到20uM。
3)狀態(tài)良好的細(xì)胞。
常用24孔板進(jìn)行報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)。分細(xì)胞時(shí)保證細(xì)胞鋪板均勻(搖勻細(xì)胞的方法見細(xì)胞培養(yǎng)的方法),每孔細(xì)胞數(shù)目相當(dāng)。以293ET細(xì)胞為例,我們轉(zhuǎn)染的密度一般在60-80%作用,如果用威格拉斯轉(zhuǎn)染試劑,細(xì)胞密度可以稍高些,因?yàn)檗D(zhuǎn)染后細(xì)胞死亡較多。

轉(zhuǎn)染
轉(zhuǎn)染時(shí)必須配總體系再依次分成小體系。這一步?jīng)Q定著每個(gè)孔的平行性和實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性。轉(zhuǎn)染核酸用量為每孔:luc-3UTR 200ng;TK 50ng;miRNA-pcDNA3.1 1ug或合成的miRNA 2.5ul(終濃度100nM)。Vig每孔用量為1ullip20002ul。轉(zhuǎn)染后4-6h換液。如果用vig轉(zhuǎn)染必須及時(shí)換液,否則細(xì)胞會(huì)尸橫遍野。注意設(shè)立合理的對(duì)照,通常用pcDNA3.1(或miRNA NC)代替miRNA-pcDNA3.1miRNA)做miRNA的對(duì)照。

收細(xì)胞
轉(zhuǎn)染24-48h可以收取細(xì)胞。用生理鹽水或PBS清洗細(xì)胞兩次,因293細(xì)胞極易脫落,建議操作溫柔,如果對(duì)自己的操作沒有自信,可以增大生理鹽水量只洗一次。之后吸干生理鹽水。每孔加入80ul 1Xpassive buffer(裂解液的量可視細(xì)胞數(shù)目稍作調(diào)整),室溫?fù)u20min,如果細(xì)胞裂解充分會(huì)看到白色粘稠狀細(xì)胞碎片。如果不馬上測(cè),可連同24孔板凍于-80度,測(cè)時(shí)再取出解凍。-20度可保存一周。4度可保存一天。

3.測(cè)定熒光素酶活性

測(cè)定熒光素酶活性需使用質(zhì)量好的ELISA試劑盒,雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng):bufferII為螢火蟲熒光素酶的底物,測(cè)量數(shù)值為我們的報(bào)告基因的活性;S&G buffer 作用是淬滅螢火蟲熒光素酶的活性并提供海腎熒光素酶反應(yīng)的緩沖環(huán)境,測(cè)定的數(shù)值為內(nèi)參的活性。測(cè)定時(shí),取細(xì)胞裂解液8ul96孔板中(的96孔板)上機(jī)測(cè)量。每種底物每孔加30ul

4.結(jié)果分析
測(cè)定熒光素酶后會(huì)返回三個(gè)值:螢火蟲熒光素酶活性、海腎熒光素酶活性及兩者的比值。比值將作為zui后的分析數(shù)據(jù),反映了該孔報(bào)告基因的相對(duì)活性。通常將對(duì)照歸一為1,實(shí)驗(yàn)組與其相比取相對(duì)值。此相對(duì)值用于zui后作圖和統(tǒng)計(jì)分析。2.GFP報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)

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